Les missions du Comité d’Alqods se répartissent en deux volets :
Premier volet : Volet politique et diplomatique
Le Comité œuvre à soutenir toutes les initiatives visant à instaurer une paix juste et globale dans la région, en particulier en affirmant la souveraineté sur Alqods, y compris le Haram Al-Sharif et tous les lieux saints chrétiens et islamiques, qui font partie des territoires palestiniens occupés depuis juin 1967.
Deuxième volet : Volet social sur le terrain
Elle se préoccupe de la protection de la ville sainte, de la préservation de son patrimoine religieux, culturel et humain, et de la résistance aux projets de sa judaïsation, aux tentatives d’effacement de son identité arabe et islamique, de modification de son statut légal, et de perturbation de son équilibre naturel, démographique, urbain et environnemental. Elle œuvre également à la mise en œuvre de projets sociaux ayant un impact concret sur les habitants de la ville dans divers aspects de leur vie quotidienne.